Depuis sa création, l’Aprodeped se dévoue pour la défense et la promotion des droits des personnes vulnérables.
Pour y parvenir, elle a mis en place plusieurs programmes thématiques dans le cadre desquels elle exécute une série d’activités avec l’appui technique et financier des partenaires nationaux et internationaux.
Il s’agit des programmes ci-après:

1. Lutte contre la peine de mort, la torture et autres traitements cruels, inhumains et dégradants;
2. Réforme foncière et sécurisation juridique des terres rurales;
3. Droits de l'homme et exploitation des ressources naturelles;
4. Promotion de la femme et lutte contre les violences sexuelles et celles basées sur le genre;
5. Droits des prisonniers et humanisation de l'univers carcéral;
6. Renforcement des services administratifs de base;
7. Droits des minorités, des peuples autochtones et lutte contre les discriminations;
8. Promotion de l'accès à la justice et aux services administratifs;
9. Education au droit, aux droits de l'homme et aux mécanismes de leur défense;
10. Droits de l'homme, protection de l'environnement et justice climatique.
11. Droits de l’homme et santé sexuelle et reproductive